MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W1964733653 · doi:10.1093/nar/gkt997

JASPAR 2014: an extensively expanded and updated open-access database of transcription factor binding profiles

2013· article· en· W1964733653 sur OpenAlexfundno aff
Anthony Mathelier, Xiaobei Zhao, Allen W. Zhang, François Parcy, Rebecca Worsley-Hunt, David J. Arenillas, Sorana Buchman, Chih‐Yu Chen, Alice Chou, Hans Ienasescu, Jonathan Lim, Casper Shyr, Ge Tan, Michelle Zhou, Boris Lenhard, Albin Sandelin, Wyeth W. Wasserman

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSeventh Framework ProgrammeH. Lundbeck A/SLundbeckfondenGenome British ColumbiaMichael Smith Health Research BCNational Institute of General Medical SciencesMedical Research CouncilCentre National de la Recherche ScientifiqueNovo NordiskUniversitetet i BergenGenome Canada
Mots-clésBiologyTranscription factorComputational biologyDNA binding siteGeneticsDatabaseBioinformaticsPromoterComputer scienceGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OpenAlex consigne un résumé pour ce travail, mais il n'a pas pu être récupéré à l'instant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,132

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0070,009
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0390,067

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 031
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNucleic Acids Research→Même sujetGenomics and Chromatin Dynamics→Travaux en français237 207→