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Enregistrement W1964749380 · doi:10.1021/bi000038o

Val<sup>659</sup>→Glu Mutation within the Transmembrane Domain of ErbB-2:  Effects Measured by <sup>2</sup>H NMR in Fluid Phospholipid Bilayers

2000· article· en· W1964749380 sur OpenAlexaff
Simon Sharpe, Kathryn R. Barber, Chris W.M. Grant

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransmembrane domainTransmembrane proteinChemistryAlanineBiochemistryAmino acidMutantSalt bridgeStereochemistryBiophysicsBiologyReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Certain point mutations within the hydrophobic transmembrane domains of class I receptor tyrosine kinases have been associated with oncogenic transformation in vitro and in vivo [Gullick, J., and Srinivasan, R. (1998) Breast Cancer Res. Treat. 52, 43-53]. An important example is the replacement of a single (hydrophobic) valine by (charged) glutamate in the rat protein, Neu, and in the homologous human protein, ErbB-2. It has been suggested that the oncogenic nature of this Val-->Glu substitution may derive from alteration of the transmembrane domain's ability to take part in direct side-to-side associations. In the present work, we examined the basis of this phenomenon by studying transmembrane portions of ErbB-2 in fluid bilayer membranes. An expression system was designed to produce such peptides from the wild-type ErbB-2, and from an identical region of the transforming mutant in which Val(659) is replaced by Glu. All peptides were 50-mers, containing the appropriate transmembrane domain plus contiguous stretches of amino acids from the cytoplasmic and extracellular domains. Deuterium heteronuclear probes were incorporated into alanine side chains (thus, each alanine -CH(3) side chain became -CD(3)). Given the presence of natural alanine residues at positions 648 and 657 within ErbB-2, this approach afforded heteronuclear probes within the motif Ser(656)AlaValValGlu(660), thought to be important for homodimer formation, and nine residues upstream of this site. Further peptides were produced, by site-directed mutagenesis, to confirm spectral assignments and to provide an additional probe location at position 670 (11 residues downstream of the motif region). On SDS-polyacrylamide gels, the transmembrane peptides migrated as predominant monomers in equilibrium with smaller populations of homodimers/-oligomers. CD spectra of both wild-type and transforming mutant peptides were consistent with the transmembrane portions being basically alpha-helical. (2)H NMR spectra of each transmembrane peptide were obtained in fluid phospholipid bilayers of 1-palmitoyl-2-oleoylphosphatidylcholine (POPC) from 35 to 65 degrees C. Results were consistent with the concept that the glutamic acid residue characterizing the mutant is uncharged at neutral pH. Narrowed spectral components from species rotating rapidly and symmetrically within the membrane appeared to represent monomeric peptide. Mutation of Val(659) to Glu within the hydrophobic domain induced changes in side chain angulation of at least 6-8 degrees at Ala(657) (i.e., within the five amino acid motif thought to be involved in homodimer formation), and downstream of this site to residue 670. There was little evidence of effect at the upstream site (Ala(648)) at the membrane surface. This result argues that the transforming mutation is associated with significant intramolecular rearrangement of the monomeric transmembrane helix-extending over some four helix turns-which could influence its lateral associations. In addition, temperature effects on spectral quadrupole splittings suggested that there is greater peptide backbone flexibility for the wild-type transmembrane region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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