Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the tetracycline-degrading monooxygenase TetX2 from<i>Bacteroides thetaiotaomicron</i>
Notice bibliographique
Résumé
The flavin-dependent monooxygenase TetX2 from Bacteroides thetaiotaomicron confers resistance against tetracyclines in aerobically grown Escherichia coli. TetX2 modifies several tetracycline antibiotics by regioselective hydroxylation of the substrates to 11a-hydroxy-tetracyclines. X-ray diffraction data were collected from a native TetX2 crystal and a TetX2 crystal with incorporated selenomethionine to resolutions of 2.5 and 3.0 A, respectively. The native crystal belonged to the triclinic space group P1, with unit-cell parameters a = 68.55, b = 80.88, c = 87.53 A, alpha = 111.09, beta = 98.98, gamma = 93.38 degrees , whereas the selenomethionine-labelled TetX2 crystal belonged to the monoclinic space group P2(1), with unit-cell parameters a = 87.34, b = 68.66, c = 152.48 A, beta = 101.08 degrees .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».