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Enregistrement W1964853412 · doi:10.1101/pdb.prot080341

Monitoring Autophagy in <i>Drosophila</i> Using Fluorescent Reporters in the UAS-GAL4 System

2014· article· en· W1964853412 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCold Spring Harbor Protocols · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésmCherryATG8AutophagyGreen fluorescent proteinCell biologyAutophagosomeChemistryBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Following autophagy induction, the autophagy-related protein Atg8 undergoes ubiquitin-like conjugation to phosphatidylethanolamine and inserts into the autophagosome membrane. Transgenic Drosophila lines expressing Drosophila Atg8 (DrAtg8a) fused to green fluorescent protein (GFP), mCherry, or dual-tagged GFP-mCherry have been constructed and are extremely useful for monitoring autophagy. The use of GFP-mCherry-Atg8a is particularly advantageous because it allows for the assessment of autophagy induction as well as autophagy flux. GFP-mCherry-Atg8a fluoresces yellow in nonacidic structures including the autophagosome. When autophagosomes fuse with lysosomes to form autolysosomes, GFP fluorescence is quenched by the acidic hydrolases and the resulting autolysosome will fluoresce red. The upstream activating sequence (UAS)-GAL4 system allows for the ectopic expression of the gene of interest (in this case, DrAtg8a) in a tissue-specific manner. Here we provide a protocol for monitoring autophagic flux by fluorescence microscopy by expressing UASp-GFP-mCherry-DrAtg8a in the Drosophila germline.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,153
Score d'incertitude au seuil0,797

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle