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Enregistrement W1964862889 · doi:10.1094/pdis-08-12-0752-re

Reaction of Lines of the Rapid Cycling Brassica Collection and <i>Arabidopsis thaliana</i> to Four Pathotypes of <i>Plasmodiophora brassicae</i>

2012· article· en· W1964862889 sur OpenAlexafffund
Kalpana Sharma, B. D. Gossen, David L. Greenshields, Gopalan Selvaraj, Stephen E. Strelkov, Mary Ruth McDonald

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of AlbertaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésClubrootBiologyBrassicaArabidopsis thalianaBrassica rapaSporeInoculationBrassica oleraceaBotanyBrassicaceaeBrassica carinataHorticultureMutantGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The clubroot reaction of five Rapid Cycling Brassica Collection (RCBC) lines (Brassica carinata, B. juncea, B. napus, B. oleracea, and B. rapa) and 84 lines of Arabidopsis thaliana to pathotypes 2, 3, 5, and 6 of Plasmodiophora brassicae (as classified on William's system) was assessed. Also, the reaction of the Arabidopsis lines to a single-spore isolate of each of pathotypes 3 and 6 was compared with that of a field isolate. Seedlings were inoculated with resting spores of P. brassicae, maintained at 25 and 20°C (day and night, respectively), and assessed for clubroot incidence and severity at 6 weeks after inoculation. Several lines of A. thaliana and RCBC exhibited a differential response to pathotype but none of the lines were immune. Among the RCBC lines, B. napus was resistant to all of the pathotypes; B. oleracea was resistant to pathotypes 2, 3, and 5; B. carinata and B. rapa were resistant to pathotypes 2 and 5; and B. juncea was susceptible to pathotypes 5 and 6 and had an intermediate response to pathotypes 2 and 3. Line Ct-1 of A. thaliana was highly resistant to pathotype 2, Pu2-23 was highly resistant to pathotype 5, and Ws-2 and Sorbo were highly resistant to pathotype 6. These results indicate that the lines of RCBC and A. thaliana have potential for use as model crops for a wide range of studies on clubroot, and could be used to differentiate these four pathotypes of P. brassicae. The reaction of the RCBC lines to pathotype 6 was highly correlated with response under field conditions but the reaction to the single-spore isolates of pathotypes 3 and 6 was not strongly correlated with reaction to the field collections in the Arabidopsis lines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,715
Score d'incertitude au seuil0,153

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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