No Association between Visfatin <i>(NAMPT)</i> Gene Variants and Metabolic Traits in the Newfoundland Population
Notice bibliographique
Résumé
Objective Visfatin is a novel adipokine initially reported to exhibit insulin-mimetic effects that increase insulin sensitivity. Further studies indicate it may also be associated with obesity, serum lipids, and systemic inflammation. At the current time, the role of genetic variation in the visfatin gene (NAMPT) on these parameters is not clear. In the present study, we examined the association between 10 SNPs in NAMPT and insulin resistance, obesity, serum lipids and hsCRP levels. Research design and methods A total of 1838 subjects (413 men, 1425 women) were recruited from the ongoing CODING Study. All subjects were from the genetically homogenous population of Newfoundland and Labrador, Canada. BMI, waist circumference, waist-to-hip ratio, and body fat percentage (determined using DXA) were measured for all subjects. Serum glucose, insulin, HOMA IR , HOMAβ, total cholesterol, HDL cholesterol, LDL cholesterol, triglycerides and hsCRP were also determined after a 12-hour fast. Ten SNPs in NAMPT were genotyped using TaqMan validated or functionally tested SNP genotyping assays including rs7789066 (A > G 5′ flanking region), rs3801266 (A > G intron), rs6963243 (G > C intron), rs2058539 (A > C intron), rs6947766 (C > T intron), rs4730153 (G > A intron), rs10808150 (G > A intron), rs2098291 (C > T intron), rs10953502 (T > C intron), and rs10953501 (A > G 3′ UTR). Results We observed no significant associations between any of the variants sites and any parameter of insulin resistance, body composition, serum lipids or hsCRP under an additive model with age and gender included as covariates. This was also true when both dominant and recessive models were applied. Conclusions Our results do not support a significant role for variations in NAMPT with differences in the measured variables in the Newfoundland population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».