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Enregistrement W1965049312 · doi:10.5539/jfr.v4n1p58

Mechanism of Resistance to Macrolide-Lincosamide-Streptogramin Antibiotics in Streptococcus thermophilus

2014· article· en· W1965049312 sur OpenAlexvenueno aff
George A. Somkuti, John A. Renye, Dennis H. Steinberg

Notice bibliographique

RevueJournal of Food Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLincomycin23S ribosomal RNALincosamidesMicrobiologySpiramycinBiologyMutantJosamycinTylosinTetracyclineTelithromycinAntibioticsGeneticsErythromycinGeneRibosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Resistance to macrolide-lincosamide-streptogramin (MLS) group antibiotics in the dairy bacterium Streptococcus thermophilus (ST) is documented but the mechanism of resistance has not been elucidated. MIC values for erythromycin (Erm), azithromycin (Azm), tylosin (Tyl), spiramycin (Spm), pristinamycin (Prm) and virginiamycin S (Vir) were determined by the disk diffusion method. PCR products were obtained with primer pairs for the L4, L22 and 23S rDNA (domain V) genes. The sequencing results ruled out mutations in the L4 and L22 ribosomal proteins and the presence of rRNA methylase, efflux, and inactivating genes. However, sequencing of domain V in each of the six ribosomal alleles detected by EcoRI/I-CeuI digestion in ST mutants identified three types of mutations that led to MLS resistance. Type A mutants, induced by Erm, had high resistance to 14- and 15-membered ring macrolides (Erm, Azm) and streptogramin B antibiotics (Prm, Vir), moderate resistance to 16-membered ring macrolides (Tyl, Spm), but remained susceptible to lincomycin. In Type B mutants, also induced by Erm, resistance was high to Erm, Tyl and Spm, and moderate to lincomycin but sensitivity was retained to Prm. Type C mutants, induced by Prm, showed high resistance to 16-membered ring macrolides but remained sensitive to Erm, Azm and lincomycin. The three identifiable resistance patterns were apparently due to point mutations in domain V of the 23S rRNA gene, resulting in three phenotypes among resistant S. thermophilus isolates. Type A phenotype mutants had a C2611G mutation in five of the six ribosomal alleles, Type B phenotypes had a A2058G mutation in five alleles, and Type C variants had a A2062C mutation in all six alleles. Resistance to MLS antibiotics in S. thermophilus was inducible by 14- and 15-membered ring macrolides and streptogramin B type antibiotics but not by 16-membered ring macrolides or lincosamides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
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