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Enregistrement W1965097026 · doi:10.1042/bj20021333

SEA (sea-urchin sperm protein, enterokinase and agrin)-module cleavage, association of fragments and membrane targeting of rat intestinal mucin Muc3

2003· article· en· W1965097026 sur OpenAlexaff
Ismat Khatri, Rongquan Wang, J. Forstner

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCleavage (geology)SerineEndoglycosidase HEndoplasmic reticulumSea urchinGlycosylationTunicamycinBiologyMucinBiochemistryChemistryMolecular biologyCell biologyGolgi apparatusPhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In a previous study we showed, by transient expression studies in COS-1 cells, that the C-terminal domain of rat intestinal membrane mucin Muc3 was cleaved between glycine and serine within a GSIVV (one-letter) amino acid sequence during its residence in the endoplasmic reticulum. The extracellular domain fragment remained linked to the membrane-associated fragment by non-covalent interactions. The present study demonstrates that cleavage depends not only on the presence of the G/SIVV site (where G/S is the glycine downward arrow serine cleavage site), but also on more distant C-terminal sequences in the SEA (sea-urchin sperm protein, enterokinase and agrin) module. Inhibition of N-glycosylation by tunicamycin treatment of transfected cells did not prevent re-association of fragments, although cleavage was partially impaired, as some of the non-glycosylated, non-cleaved products were seen to accumulate in cells. Membrane targeting of the Muc3 domain and its cleavage products occurred in transfected cells and was not impaired in mutants in which the cleavage site was mutated. Targeting was also not impaired for products devoid of N-linked oligosaccharides. Our studies thus indicate that (a) cleavage within the SEA module of rat Muc3 requires participation of peptide sequences located C-terminal of and distant from the cleavage site, (b) re-association of the fragments requires the SEA module, but is independent of N-linked oligosaccharides, and (c) membrane targeting of the mucin is independent of the SEA-module-cleavage reaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,479

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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