Redefining prognostic factors for breast cancer: YB-1 is a stronger predictor of relapse and disease-specific survival than estrogen receptor or HER-2 across all tumor subtypes
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: Gene expression analysis is used to subtype breast cancers such that the most aggressive tumors are identified, but translating this into clinical practice can be cumbersome. Our goal is to develop a universal biomarker that distinguishes patients at high risk across all breast cancer subtypes. We previously reported that Y-box binding protein-1 (YB-1), a transcription/translation factor, was a marker of poor prognosis in a cohort of 490 patients with breast cancer, but the study was not large enough to subtype the cancers. We therefore investigated whether YB-1 identifies patients at risk for either reduced relapse free survival or decreased r breast cancer specific survival (BCSS) across all tumor subtypes by evaluating 4,049 cases. METHODS: Tumor tissue microarrays, representing 4,049 cases of invasive breast cancers with 20 years of follow up, were subtyped by the expression profiles of estrogen receptor, progesterone receptor, or HER-2. We then addressed whether YB-1 expression identified patients at higher risk for relapse and/or lower BCSS. RESULTS: We found YB-1 to be a highly predictive biomarker of relapse (P < 2.5 x 10(-20)) and poor survival (P < 7.3 x 10(-26)) in the entire cohort and across all breast cancer subtypes. Patients with node-positive or node-negative cancer were more likely to die from the disease if YB-1 was expressed. This was further substantiated using a Cox regression model, which revealed that it was significantly associated with relapse and poor survival in a subtype independent manner (relapse patients, hazard ratio = 1.28, P < 8 x 10(-3); all patients, hazard ratio = 1.45, P < 6.7 x 10(-7)). Moreover, YB-1 was superior to estrogen receptor and HER-2 as a prognostic marker for relapse and survival. For a subset of patients who were originally considered low risk and were therefore not given chemotherapy, YB-1 was indicative of poor survival (P < 7.1 x 10 (-17)). Likewise, YB-1 was predictive of decreased BCSS in tamoxifen-treated patients (P = 0.001); in this setting a Cox regression model once again demonstrated it to be an independent biomarker indicating poor survival (hazard ratio = 1.70, P = 0.022). CONCLUSIONS: Expression of YB-1 universally identifies patients at high risk across all breast cancer subtypes and in situations where more aggressive treatment may be needed. We therefore propose that YB-1 may re-define high-risk breast cancer and thereby create opportunities for individualized therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».