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Enregistrement W1965421340 · doi:10.1634/stemcells.2008-0558

Don't Look: Growing Clonal Versus Nonclonal Neural Stem Cell Colonies

2008· article· en· W1965421340 sur OpenAlexafffund
Brenda L.K. Coles-Takabe, Ian Brain, Kelly A. Purpura, Phillip Karpowicz, Peter W. Zandstra, Cindi M. Morshead, Derek van der Kooy

Notice bibliographique

RevueStem Cells · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchStem Cell Network
Mots-clésNeurosphereBiologyNeural stem cellCell biologyStem cellMolecular biologyGeneticsCellular differentiationGeneAdult stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent reports have challenged the clonality of the neurosphere assay in assessing neural stem cell (NSC) numbers quantitatively. We tested the clonality of the neurosphere assay by culturing mixtures of differently labeled neural cells, watching single neural cells proliferate using video microscopy, and encapsulating single NSCs and their progeny. The neurosphere assay gave rise to clonal colonies when using primary cells plated at 10 cells/microl or less; however, when using passaged NSCs, the spheres were clonal only if plated at 1 cell/microl. Most important, moving the plates during the growth phase (to look at cultures microscopically) greatly increased the incidence of nonclonal colonies. To ensure clonal sphere formation and investigate nonautonomous effects on clonal sphere formation frequencies, single NSCs were encapsulated in agarose and proliferated as clonal free-floating spheres. We demonstrate that clonal neurospheres can be grown by avoiding movement-induced aggregation, by single-cell tracking, and by encapsulation of single cells. Disclosure of potential conflicts of interest is found at the end of this article.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations163
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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