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Enregistrement W1965648118 · doi:10.1021/jp040373c

Electronic and Steric Influence of Trans Axial Base on the Stereoelectronic Properties of Cobalamins

2004· article· en· W1965648118 sur OpenAlexaff
Pawel M. Kozlowski, Marek Z. Zgierski

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePorphyrin Metabolism and Disorders
Établissements canadiensSteacie Institute for Molecular Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCorrinHeterolysisHomolysisSteric effectsChemistryBond-dissociation energyBond cleavageStereochemistryDensity functional theoryBond energyDissociation (chemistry)Bond lengthCrystallographyBond orderPhotochemistryComputational chemistryCobaltMoleculeOrganic chemistryRadicalCrystal structureCatalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Density functional theory (DFT) has been applied to investigate the relationship between steric and electronic properties of the trans axial base and energetics of Co−C bond cleavage in models of coenzyme B 12 . By using structurally reliable six-coordinate models, B-[Co III (corrin)]-R +, it was shown that for a given base (B) the energy of homolytic cobalt−carbon bond cleavage correctly follows the Co−C R bond lengthening. For a given axial ligand (R) the dissociation energy is very weakly dependent on the trans axial base and correlates with its basicity. Analysis of the five-coordinate homolysis products, B-[Co II (corrin)] +, shows that the Co II −N B bond length is in the range of ∼2.2 Å, slightly shorter in comparison to six-coordinate analogues, while five-coordinate heterolysis products, B-[Co III (corrin)] +2, have the Co III −N B bond significantly shorter ∼1.9 Å. This noticeable difference suggests that controlling the Co−N B bond length could be an effective way to promote biologically important homolysis of the Co−C bond in B 12 -dependent enzymes over abiological heterolysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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