Cumulus cell gene expression associated with pre-ovulatory acquisition of developmental competence in bovine oocytes
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The final days before ovulation impact significantly on follicular function and oocyte quality. This study investigated the cumulus cell (CC) transcriptomic changes during the oocyte developmental competence acquisition period. Six dairy cows were used for 24 oocyte collections and received FSH twice daily over 3 days, followed by FSH withdrawal for 20, 44, 68 and 92 h in four different oestrous cycles for each of the six cows. Half of the cumulus-oocyte complexes were subjected to in vitro maturation, fertilisation and culture to assess blastocyst rate. The other half of the CC underwent microarray analysis (n=3 cows, 12 oocyte collections) and qRT-PCR (n=3 other cows, 12 oocyte collections). According to blastocyst rates, 20 h of FSH withdrawal led to under-differentiated follicles (49%), 44 and 68 h to the most competent follicles (71% and 61%) and 92 h to over-differentiated ones (51%). Ten genes, from the gene lists corresponding to the three different follicular states, were subjected to qRT-PCR. Interestingly, CYP11A1 and NSDHL gene expression profiles reflected the blastocyst rate. However most genes were associated with the over-differentiated status: GATM, MAN1A1, VNN1 and NRP1. The early period of FSH withdrawal has a minimal effect on cumulus gene expression, whereas the longest period has a very significant one and indicates the beginning of the atresia process.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle