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Enregistrement W1966019271 · doi:10.1212/01.wnl.0000345363.65799.35

A mechanism for low penetrance in an ALS family with a novel <i>SOD1</i> deletion

2009· article· en· W1966019271 sur OpenAlexaffabout
Lorne Zinman, H. N. Liu, Christine Sato, Yosuke Wakutani, Amanda F. Marvelle, Danielle Moreno, Karen Morrison, Karen L. Mohlke, J. M. Bilbao, Janice Robertson, Ekaterina Rogaeva

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensSunnybrook Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPenetranceExonProbandGeneticsAmyotrophic lateral sclerosisSOD1AlleleBiologyMutationRNA splicingMutantGeneMedicineDiseasePhenotypePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: About 20% of familial amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is caused by mutations in SOD1 and is typically transmitted as an autosomal dominant trait. However, due to reduced mutation penetrance, the disease may present in a recessive or sporadic manner. OBJECTIVE: To determine the factors responsible for the low penetrance of the SOD1 mutation. METHODS: Twelve members of a Canadian ALS family of Filipino origin were recruited for the study. SOD1 was sequenced in the proband. SOD1 expression was assessed by real-time-PCR and immunoblotting. RESULTS: The proband was a homozygous carrier of a novel 6 bp deletion in exon 2 (DeltaG27/P28), the pathologic significance of which was confirmed by immunohistochemistry. Eight living family members are heterozygotes and remain unaffected at ages ranging between 48 and 85 years. Haplotype analysis showed that the deletion is a single founder mutation likely common in the Cagayan province (Philippines). The low penetrance of the mutation is explained by the fact that it enhances the naturally occurring alternative splicing of exon 2 of the SOD1 mRNA, leading to reduced transcription of the mutant allele. Indeed, Western blot analysis demonstrated the low level of SOD1 protein in carriers of the DeltaG27/P28 compared to wild-type individuals or a carrier of the A4V SOD1 mutation. CONCLUSION: The enhanced splicing of exon 2 acts as a natural knock-down of the mutant SOD1 allele in the Filipino amyotrophic lateral sclerosis (ALS) family. There is a need for careful investigation of splicing isoforms of SOD1 and other ALS genes as factors influencing the severity of disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,982
Score d'incertitude au seuil0,363

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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