Transcriptional Properties of Ptx1 and Ptx2 Isoforms
Notice bibliographique
Résumé
The Ptx (Pitx) family of homeobox transcription factors comprises Ptx1, Ptx2 and Ptx3. Ptx1 and Ptx2 are expressed in the stomodeum and its derivatives including the pituitary, as well as in mesodermal derivatives, whereas Ptx3 is expressed in one neuronal lineage of the brain and in the eyes. A large set of downstream target genes have been identified for Ptx1 in the pituitary gland where it acts as a pan-pituitary regulator of transcription. In particular, Ptx1 contributes to promoter- and lineage-specific transcription by interaction with cell-restricted factors such as SF-1, Egr-1, Pit1, and the basic helix-loop-helix heterodimer NeuroD1/Pan1. We describe the cloning from pituitary cells and the characterization of a Ptx1 isoform, named Ptx1b, generated by alternative promoter usage. The two Ptx1 and two Ptx2 isoforms have similar in vitro DNA binding specificities and they all activate transcription driven by a panel of pituitary promoters, including those for proopiomelanocortin, alphaGSU, LHbeta, FSHbeta, GnRH-R, TSHbeta, PRL, and GH. Also like Ptx1, the Ptx1b, Ptx2a, and Ptx2b transcription factors synergize with the structurally unrelated factors SF-1, Egr-1, Pit1, and NeuroD1/Pan1 to activate promoter-specific transcription. In conclusion, the pituitary transcriptional activities of the four Ptx isoforms do not appear to be dependent on the variant N-termini of these factors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».