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Enregistrement W1966033150 · doi:10.1038/ajg.2009.267

Phenotypic and Genotypic Characteristics of Inflammatory Bowel Disease in French Canadians: Comparison With a Large North American Repository

2009· article· en· W1966033150 sur OpenAlexaffabout
Mamatha Bhat, Geoffrey C. Nguyen, Pierre Paré, Raymond Lahaie, Colette Deslandres, Edmond-Jean Bernard, Guy Aumais, Gilles Jobin, Gary Wild, Albert Cohen, Diane Langelier, Steven R. Brant, Themistocles Dassopoulos, Dermot McGovern, Esther A. Torres, Richard H. Duerr, Miguel Regueiro, Mark S. Silverberg, Hillary Steinhart, Anne M. Griffiths, Abdul Elkadri, Judy H. Cho, Deborah D. Proctor, Philippe Goyette, John D. Rioux, Alain Bitton

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensMontreal Heart InstituteCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeJewish General HospitalMontreal General HospitalHôpital Maisonneuve-RosemontCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de MontréalHôpital Saint-LucHôpital du Saint-SacrementRoyal Victoria HospitalUniversité de SherbrookeUniversity of TorontoHôtel-Dieu de MontréalMount Sinai HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Mental Health
Mots-clésMedicineInflammatory bowel diseaseOdds ratioSingle-nucleotide polymorphismUlcerative colitisNOD2Internal medicineDiseaseCrohn's diseaseGenotypePopulationGastroenterologyGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Phenotype characteristics of inflammatory bowel disease (IBD) may differ significantly among ethnic subpopulations. The aim of this study was to characterize the IBD phenotype in French Canadians, the most prominent founder population in North America. METHODS: Using well-characterized phenotype data in the National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (NIDDK)-IBD Genetics Consortium repository on patients with IBD, we compared phenotypic characteristics of 202 French Canadians with those of 1,287 other Caucasian patients. These included diagnosis, anatomical location, disease behavior, extraintestinal manifestations, surgical history, and family history of IBD. RESULTS: French-Canadian patients with Crohn's disease (CD) were less likely to have stricturing disease (11 vs. 21%, P=0.005; odds ratio (OR): 0.45, 95% confidence interval (95% CI): 0.24-0.85). Using a stringent definition of ethnicity (three out of four grandparents being French Canadians, as opposed to self-report, n=148), French Canadians had a tendency toward developing fistulizing CD (37 vs. 28%, P=0.07), and there was an increased prevalence of sacroiliitis among those with IBD (4 vs. 2%, P=0.045). Among French Canadians, the numbers of current smokers in CD (40 vs. 25%, P=0.006) and former smokers in ulcerative colitis (UC) (35 vs. 20%, P=0.03) were significantly higher. The prevalence of one of the three main variants of nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 (NOD2) single-nucleotide polymorphisms (SNPs) among French-Canadian CD patients was 43.2%. The 3020insC SNP correlated with small bowel disease in French Canadians (25 [corrected] vs. 0%, P=0.006). CONCLUSIONS: French Canadians show an IBD phenotype profile distinct from other Caucasian IBD populations, with an accentuated association between smoking status and IBD. This unique profile may have implications regarding the need for a different approach to the management of IBD in this population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,122
Score d'incertitude au seuil0,245

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0030,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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