Real‐time RT‐PCR analysis of loblolly pine (<i>Pinus taeda</i>) arabinogalactan‐protein and arabinogalactan‐protein‐like genes
Notice bibliographique
Résumé
Arabinogalactan‐proteins (AGPs) are a class of large hydroxyproline‐rich glycoproteins (HGRPs) found in almost all plant species, and have been implicated in various plant growth and developmental processes including xylogenesis. A total of six AGP‐like genes or gene families have been cloned from differentiating pine xylem. In this study, seven different members of the ptaAGP5 gene family with between 54% and 73% similarity at the amino acid level were newly identified. Gene‐specific primers were designed and relative transcript levels of 11 loblolly pine AGP and AGP‐like genes were examined using real‐time reverse transcription‐polymerase chain reaction (RT‐PCR) analysis. Expression was examined in different tissues: earlywood and latewood; xylem from two populations; drought‐stressed and well‐watered roots; compression, opposite and vertical wood; and in vitro cultured cells induced for lignification. The different loblolly pine AGP and AGP‐like genes showed varying expression patterns under the different conditions, suggesting different functions for each loblolly pine AGP. The results from this study also suggest that some AGPs are associated with xylogenesis, but not with lignification, and that different xylem AGPs probably have different functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».