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Enregistrement W1966251970 · doi:10.1034/j.1399-3054.2000.110214.x

Detection and seasonal expression pattern of a pathogenesis‐related protein (PR‐10) in Douglas‐fir (<i>Pseudotsuga menziesii</i>) tissues

2000· article· en· W1966251970 sur OpenAlexafffund
A.K.M. Ekramoddoullah, Xueshu Yu, Rona N. Sturrock, Arezoo Rezaie Nezhad Zamani, Doug Taylor

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest Insect Ecology and Management
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanadian Forest Service
Organismes subventionnairesUniversity of Victoria
Mots-clésBiologyDouglas firAmino acidPeptide sequenceBotanyFrost (temperature)Complementary DNAGeneProtein sequencingMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previously, a PR‐10 protein Pin m III was described in western white pine. In this study, primers based on cDNA of Pin m III were utilized to obtain the genomic sequence of a Pin m III homologue – Pse m I – in Douglas‐fir. A comparative analysis of a deduced amino acid sequence of Pin m III and Pse m I genes indicated about 80% similarity between the two protein sequences, and a consensus 20 amino acid sequence located around the p‐loop sequence was used to synthesize a peptide of 20 amino acids. An antibody to this synthetic peptide was able to detect the Pse m I protein in Douglas‐fir. The anti‐ Pse m I antibody was used in a western immunoblot to monitor seasonal variation of the Pse m I in Douglas‐fir needles and its level was shown to increase with overwintering of Douglas‐fir seedlings. However, unlike the Pin m III, there is no indication that the Pse m I is associated with frost hardiness. Analysis of infected Douglas‐fir roots showed a possible trend to up‐regulation of Pse m I by pathogens such as the laminated root rot fungus, Phellinus weirii . The expression of Pse m I protein in Douglas‐fir seedlings is very low compared to the expression of Pin m III protein in western white pine seedlings. In addition, a light‐harvesting complex I protein, PSI‐F, was identified in Douglas‐fir by N‐terminal amino acid sequencing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,901
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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