Detection and seasonal expression pattern of a pathogenesis‐related protein (PR‐10) in Douglas‐fir (<i>Pseudotsuga menziesii</i>) tissues
Notice bibliographique
Résumé
Previously, a PR‐10 protein Pin m III was described in western white pine. In this study, primers based on cDNA of Pin m III were utilized to obtain the genomic sequence of a Pin m III homologue –Pse m I – in Douglas‐fir. A comparative analysis of a deduced amino acid sequence of Pin m III and Pse m I genes indicated about 80% similarity between the two protein sequences, and a consensus 20 amino acid sequence located around the p‐loop sequence was used to synthesize a peptide of 20 amino acids. An antibody to this synthetic peptide was able to detect the Pse m I protein in Douglas‐fir. The anti‐Pse m I antibody was used in a western immunoblot to monitor seasonal variation of the Pse m I in Douglas‐fir needles and its level was shown to increase with overwintering of Douglas‐fir seedlings. However, unlike the Pin m III, there is no indication that the Pse m I is associated with frost hardiness. Analysis of infected Douglas‐fir roots showed a possible trend to up‐regulation of Pse m I by pathogens such as the laminated root rot fungus, Phellinus weirii. The expression of Pse m I protein in Douglas‐fir seedlings is very low compared to the expression of Pin m III protein in western white pine seedlings. In addition, a light‐harvesting complex I protein, PSI‐F, was identified in Douglas‐fir by N‐terminal amino acid sequencing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».