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Enregistrement W1966401030 · doi:10.1016/j.gpb.2012.09.002

MicroRNA Regulation in Extreme Environments: Differential Expression of MicroRNAs in the Intertidal Snail <i>Littorina Littorea</i> During Extended Periods of Freezing and Anoxia

2012· article· en· W1966401030 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueGenomics Proteomics & Bioinformatics · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésLittorinaSnailIntertidal zonemicroRNABiologyEcologyGeneGastropodaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Several recent studies of vertebrate adaptation to environmental stress have suggested roles for microRNAs (miRNAs) in regulating global suppression of protein synthesis and/or restructuring protein expression patterns. The present study is the first to characterize stress-responsive alterations in the expression of miRNAs during natural freezing or anoxia exposures in an invertebrate species, the intertidal gastropod Littorina littorea. These snails are exposed to anoxia and freezing conditions as their environment constantly fluctuates on both a tidal and seasonal basis. The expression of selected miRNAs that are known to influence the cell cycle, cellular signaling pathways, carbohydrate metabolism and apoptosis was evaluated using RT-PCR. Compared to controls, significant changes in expression were observed for miR-1a-1, miR-34a and miR-29b in hepatopancreas and for miR-1a-1, miR-34a, miR-133a, miR-125b, miR-29b and miR-2a in foot muscle after freezing exposure at -6 °C for 24 h (P<0.05). In addition, in response to anoxia stress for 24 h, significant changes in expression were also observed for miR-1a-1, miR-210 and miR-29b in hepatopancreas and for miR-1a-1, miR-34a, miR-133a, miR-29b and miR-2a in foot muscle (P<0.05). Moreover, protein expression of Dicer, an enzyme responsible for mature microRNA processing, was increased in foot muscle during freezing and anoxia and in hepatopancreas during freezing. Alterations in expression of these miRNAs in L. littorea tissues may contribute to organismal survival under freezing and anoxia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,099
Score d'incertitude au seuil0,784

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle