Effects of hydrophobicity and anions on self‐assembly of the peptide EMK16‐II
Notice bibliographique
Résumé
Effects of hydrophobic and electrostatic interactions on the self-assembling process of the ionic-complementary peptide EMK16-II are investigated by atomic force microscopy imaging, circular dichroism spectra, light scattering, and chromatography. It is found that the hydrophobicity of the peptide promotes the aggregation in pure water even at a very low concentration, resulting in a much lower critical aggregation concentration than that of another peptide, EAK16-II. The effect of anions in solution with different valences on electrostatic interactions is also important. Monovalent anions (Cl(-) and Ac(-)) with a proper concentration can facilitate the formation of peptide fibrils, with Cl(-) of smaller size being more effective than Ac(-) of larger size. However, only small amounts of fibrils, but plenty of large amorphous aggregates, are found when the peptide solution is incubated with multivalent anions, such as SO(4)(2-), C(6)H(5)O(7) (3-), and HPO(4)(2-). More importantly, by gel filtration chromatography, the citrate anion, which induces a similar effect on the self-assembling process of EMK16-II as that of SO(4)(2-) and HPO(4)(2-), can interact with two or more positively charged residues of the peptide and reside in the amorphous aggregates. This implies a "salt bridge" effect of multivalent anions on the peptide self-assembling process, which can interpret a previous puzzle why divalent cations inhibit the formation of ordered nanofibrils of the ionic-complementary peptides. Thus, our results clarify the important effects of hydrophobic and electrostatic interactions on the self-assembling process of the ionic-complementary peptides. These are greatly helpful for us to understand the mechanism of peptides' self-assembling process and protein folding and aggregation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».