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Enregistrement W1966554261 · doi:10.1002/bip.21340

Effects of hydrophobicity and anions on self‐assembly of the peptide EMK16‐II

2009· article· en· W1966554261 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiopolymers · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueSupramolecular Self-Assembly in Materials
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryPeptideDivalentIonic bondingCircular dichroismIonic strengthCrystallographyHydrophobic effectFibrilStatic electricitySalt bridgeElectrostaticsSelf-assemblyIonAqueous solutionOrganic chemistryPhysical chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Effects of hydrophobic and electrostatic interactions on the self-assembling process of the ionic-complementary peptide EMK16-II are investigated by atomic force microscopy imaging, circular dichroism spectra, light scattering, and chromatography. It is found that the hydrophobicity of the peptide promotes the aggregation in pure water even at a very low concentration, resulting in a much lower critical aggregation concentration than that of another peptide, EAK16-II. The effect of anions in solution with different valences on electrostatic interactions is also important. Monovalent anions (Cl(-) and Ac(-)) with a proper concentration can facilitate the formation of peptide fibrils, with Cl(-) of smaller size being more effective than Ac(-) of larger size. However, only small amounts of fibrils, but plenty of large amorphous aggregates, are found when the peptide solution is incubated with multivalent anions, such as SO(4)(2-), C(6)H(5)O(7) (3-), and HPO(4)(2-). More importantly, by gel filtration chromatography, the citrate anion, which induces a similar effect on the self-assembling process of EMK16-II as that of SO(4)(2-) and HPO(4)(2-), can interact with two or more positively charged residues of the peptide and reside in the amorphous aggregates. This implies a "salt bridge" effect of multivalent anions on the peptide self-assembling process, which can interpret a previous puzzle why divalent cations inhibit the formation of ordered nanofibrils of the ionic-complementary peptides. Thus, our results clarify the important effects of hydrophobic and electrostatic interactions on the self-assembling process of the ionic-complementary peptides. These are greatly helpful for us to understand the mechanism of peptides' self-assembling process and protein folding and aggregation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,509

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle