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Enregistrement W1966620087 · doi:10.1097/fpc.0b013e328012d0bf

A functional G300S variant of the cysteinyl leukotriene 1 receptor is associated with atopy in a Tristan da Cunha isolate

2007· article· en· W1966620087 sur OpenAlexaff
Miles D. Thompson, Valérie Capra, Jun Takasaki, Giovanna Maresca, G. Enrico Rovati, Aurther S. Slutsky, Craig M. Lilly, Noé Zamel, W. McIntyre Burnham, David E.C. Cole, Katherine Siminovitch

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAtopyAsthmaPopulationImmunologyLeukotrieneGeneticsReceptorGenetic associationBiologyGeneSingle-nucleotide polymorphismMedicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Atopy is a well-defined immune phenotype that is reported to be a risk factor for asthma. Among the many loci that contribute to a genetic predisposition to asthma, the cysteinyl leukotriene receptor genes and their variants have been important subjects of study because they are functionally and pharmacologically implicated in the atopy phenotype affecting many asthma subjects. Moreover, the product of cysteinyl-leukotriene 1 receptor gene (CysLT1), located at Xq13.2, is targeted by LT receptor antagonists. In our earlier association study, the M201V variant of the cysteinyl-leukotriene 2 receptor gene (CysLT2), located at 13q14, was implicated in atopic asthma. Here we report the screening of the coding region of the CysLT1, gene in the highly asthmatic Tristan da Cunha population. In this population, we discovered a CysLT1 G300S variant that is carried with a significantly higher frequency in atopics and asthmatics from the Tristan da Cunha population. Furthermore, we report the asthma independent association of the CysLT1 G300S variant with atopy. Subsequently, we compared the changes conferred by each SNP on CysLT function. The CysLT1 300S receptor interacts with LTD4 with significantly greater potency. For the 300S variant, a statistically significant decrease in the effector concentration for half-maximum response (EC50) for intracellular Ca flux and total InsP generation is observed. Other aspects of the receptor function and activity, such as desensitization, pharmacologic profile in response to montelukast, and cellular localization, are unchanged. These in vitro analyses provide evidence that the 300S CysLT1 variant, found more commonly in atopics in the Tristan da Cunha population, encodes a functionally more sensitive variant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,476
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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