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Enregistrement W1966657629 · doi:10.1091/mbc.e13-04-0212

The phosphatidylserine receptor TIM4 utilizes integrins as coreceptors to effect phagocytosis

2014· article· en· W1966657629 sur OpenAlexafffund
Ronald S. Flannagan, Johnathan Canton, Wendy Furuya, Michael Glogauer, Sergio Grinstein

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick Children
Mots-clésBiologyCell biologyPhagocytosisRHOARAC1Signal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

T-cell immunoglobulin mucin protein 4 (TIM4), a phosphatidylserine (PtdSer)-binding receptor, mediates the phagocytosis of apoptotic cells. How TIM4 exerts its function is unclear, and conflicting data have emerged. To define the mode of action of TIM4, we used two distinct but complementary approaches: 1) we compared bone marrow-derived macrophages from wild-type and TIM4(-/-) mice, and 2) we heterologously expressed TIM4 in epithelioid AD293 cells, which rendered them competent for engulfment of PtdSer-bearing targets. Using these systems, we demonstrate that rather than serving merely as a tether, as proposed earlier by others, TIM4 is an active participant in the phagocytic process. Furthermore, we find that TIM4 operates independently of lactadherin, which had been proposed to act as a bridging molecule. Of interest, TIM4-driven phagocytosis depends on the activation of integrins and involves stimulation of Src-family kinases and focal adhesion kinase, as well as the localized accumulation of phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate. These mediators promote recruitment of the nucleotide-exchange factor Vav3, which in turn activates small Rho-family GTPases. Gene silencing or ablation experiments demonstrated that RhoA, Rac1, and Rac2 act synergistically to drive the remodeling of actin that underlies phagocytosis. Single-particle detection experiments demonstrated that TIM4 and β1 integrins associate upon receptor clustering. These findings support a model in which TIM4 engages integrins as coreceptors to evoke the signal transduction needed to internalize PtdSer-bearing targets such as apoptotic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,146
Score d'incertitude au seuil0,755

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations125
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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