Analysis of chemotaxis when the fraction of responsive cells is small - application to mammalian sperm guidance
Notice bibliographique
Résumé
The detection of chemotaxis-related changes in the swimming behavior of mammalian spermatozoa in a spatial chemoattractant gradient has hitherto been an intractable problem. The difficulty is that the fraction of responsive cells in the sperm population is very small and that the large majority of the cells, though non-responsive, are motile too. Assessment of the chemotactic effects in a spatial gradient is also very sensitive to the quality of sperm tracking. To overcome these difficulties we propose a new approach, based on the analysis of the distribution of instantaneous directionality angles made by spermatozoa in a spatial gradient versus a no-gradient control. Although the use of this parameter does not allow identification of individual responding cells, it is a reliable measure of directionality, independent of errors in cell tracking caused by cell collisions, track crossings, and track splitting. The analysis identifies bias in the swimming direction of a population relative to the gradient direction. It involves statistical chi2 tests of the very large sample of measured angles, where the critical chi2 values are adjusted to the sample size by the bootstrapping procedure. The combination of the newly measured parameter and the special analysis provides a highly sensitive method for the detection of a chemotactic response, even a very small one.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».