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Enregistrement W1966745432 · doi:10.1139/b05-168

Nuclear targeting of the cauliflower mosaic virus (CaMV) genomeThis review is one of a selection of papers published in the Special Issue on Plant Cell Biology.

2006· article· en· W1966745432 sur OpenAlexafffundvenue
Julie Champagne, Denis Leclerc

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCauliflower mosaic virusBiologyNuclear localization sequenceNuclear transportNucleusGenomeNuclear export signalCell biologyVirusDNAVirologyPlant virusCell nucleusGeneticsTransgeneComputational biologyGeneGenetically modified crops

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The delivery of the double-stranded DNA viral genome into the nucleus is a critical step for the type member of Caulimoviridae, cauliflower mosaic virus (CaMV). The nucleocapsid (NC) of CaMV is directly involved in this process. A nuclear localization signal located at the N-terminus of the NC was shown to be exposed at the surface of the virion. This nuclear localization signal appears to be important to direct the virus to the nuclear pore complex. The nuclear targeting of the NC needs to be tightly regulated because the process of virus assembly, which also involves the viral NC, occurs in the cytosol. It is now accepted that the N- and C-terminal extensions of the viral NC precursor are efficient regulatory sequences that determine the localization of the viral NC in infected leaves. Proteolytic maturation and phosphorylation of the N- and C-terminal extensions are also important in the regulation of this process. Despite these recent discoveries, the transport of CaMV toward and into the nucleus during early events in the infection cycle remains unclear. In this review, we summarize recent advances that explain the mechanisms of targeting of the CaMV genome to the nucleus and extract from other related animal and plant viruses mechanisms that could hint at the possible strategies used by CaMV to enter the nucleus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2006
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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