Spatiotemporal Changes in the Population Structure of <i>Botryosphaeria dothidea</i> from California Pistachio Orchards
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Spatiotemporal changes in the population structure of Botryosphaeria dothidea, causal agent of panicle and shoot blight of pistachio, were analyzed by using microsatellite-primed polymerase chain reaction (MPPCR), partial sequences of the RNA polymerase II (RPB2) gene, and vegetative compatibility groups (VCGs). We examined 390 isolates, 378 recovered from pistachio in seven counties of California from 1990 to 2001 and 12 recovered from peach, apple, and sycamore in Georgia, North Carolina, South Carolina, Illinois, and Pennsylvania. Six microsatellite primers generated 116 polymorphic bands. Based on MP-PCR data, we observed very high (>98%) levels of genetic identity among populations of B. dothidea collected from the commercial pistachio orchards in California. The near identity of these populations was supported by VCGs and partial sequences of the RBP2 gene. These findings suggest that populations of B. dothidea from commercial pistachio orchards are spatially and temporally stable, at least in the past 5 years.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».