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Enregistrement W1966796219 · doi:10.1094/phyto.2004.94.4.326

Spatiotemporal Changes in the Population Structure of <i>Botryosphaeria dothidea</i> from California Pistachio Orchards

2004· article· en· W1966796219 sur OpenAlexfundno aff
Zhonghua Ma, Yong Luo, Themis J. Michailides

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversité de GenèveUniversity of AlbertaEuropean Bioinformatics Institute
Mots-clésBotryosphaeria dothideaBiologyBotryosphaeriaBotanyPopulationHorticultureDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Spatiotemporal changes in the population structure of Botryosphaeria dothidea, causal agent of panicle and shoot blight of pistachio, were analyzed by using microsatellite-primed polymerase chain reaction (MPPCR), partial sequences of the RNA polymerase II (RPB2) gene, and vegetative compatibility groups (VCGs). We examined 390 isolates, 378 recovered from pistachio in seven counties of California from 1990 to 2001 and 12 recovered from peach, apple, and sycamore in Georgia, North Carolina, South Carolina, Illinois, and Pennsylvania. Six microsatellite primers generated 116 polymorphic bands. Based on MP-PCR data, we observed very high (>98%) levels of genetic identity among populations of B. dothidea collected from the commercial pistachio orchards in California. The near identity of these populations was supported by VCGs and partial sequences of the RBP2 gene. These findings suggest that populations of B. dothidea from commercial pistachio orchards are spatially and temporally stable, at least in the past 5 years.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,718
Score d'incertitude au seuil0,379

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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