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Enregistrement W1966832433 · doi:10.1074/jbc.m504684200

Glycosylphosphatidylinositol-anchored Proteins Are Required for the Transport of Detergent-resistant Microdomain-associated Membrane Proteins Tat2p and Fur4p

2005· article· en· W1966832433 sur OpenAlexfundno aff
Michiyo Okamoto, Takehiko Yoko‐o, Mariko Umemura, Ken-ichi Nakayama, Yoshifumi Jigami

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrypanosoma species research and implications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsUniversity of TsukubaNational Institute of Advanced Industrial Science and TechnologyUniversité de GenèveRIKENEisai
Mots-clésLipid microdomainEndoplasmic reticulumPermeaseMembrane proteinBiochemistryCell biologyTryptophanMembraneMutantCell membranePeripheral membrane proteinBiologyChemistryIntegral membrane proteinAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In eukaryotic cells many cell surface proteins are attached to the membrane via the glycosylphosphatidylinositol (GPI) moiety. In yeast, GPI also plays important roles in the production of mannoprotein in the cell wall. We previously isolated gwt1 mutants and found that GWT1 is required for inositol acylation in the GPI biosynthetic pathway. In this study we isolated a new gwt1 mutant allele, gwt1-10, that shows not only high temperature sensitivity but also low temperature sensitivity. The gwt1-10 cells show impaired acyltransferase activity and attachment of GPI to proteins even at the permissive temperature. We identified TAT2, which encodes a high affinity tryptophan permease, as a multicopy suppressor of cold sensitivity in gwt1-10 cells. The gwt1-10 cells were also defective in the import of tryptophan, and a lack of tryptophan caused low temperature sensitivity. Microscopic observation revealed that Tat2p is not transported to the plasma membrane but is retained in the endoplasmic reticulum in gwt1-10 cells grown under tryptophan-poor conditions. We found that Tat2p was not associated with detergent-resistant membranes (DRMs), which are required for the recruitment of Tat2p to the plasma membrane. A similar result was obtained for Fur4p, a uracil permease localized in the DRMs of the plasma membrane. These results indicate that GPI-anchored proteins are required for the recruitment of membrane proteins Tat2p and Fur4p to the plasma membrane via DRMs, suggesting that some membrane proteins are redistributed in the cell in response to environmental and nutritional conditions due to an association with DRMs that is dependent on GPI-anchored proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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