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Enregistrement W1966929586 · doi:10.1007/s12307-008-0004-5

The Epigenetic Influence of Tumor and Embryonic Microenvironments: How Different are They?

2008· article· en· W1966929586 sur OpenAlexaff
Daniel E. Abbott, Caleb M. Bailey, Lynne‐Marie Postovit, Elisabeth A. Seftor, Naira V. Margaryan, Richard E.B. Seftor, Mary J.C. Hendrix

Notice bibliographique

RevueCancer Microenvironment · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteStowers Institute for Medical ResearchNorthwestern UniversityNational Institutes of HealthCharlotte Geyer Foundation
Mots-clésReprogrammingTumor microenvironmentEpigeneticsBiologyTransdifferentiationEmbryonic stem cellCancer researchMelanomaPhenotypeCell biologyExtracellular matrixStem cellCellGeneticsTumor cellsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The microenvironment is being increasingly recognized as a critical component in tumor progression and metastases. As such, the bi-directional signaling of extracellular mediators that promote tumor growth within the microenvironment is a focus of intense scrutiny. Interestingly, there are striking similarities between the phenotypes of aggressive tumor and embryonic stem cells, particularly with respect to specific signaling pathways underlying their intriguing plasticity. Here, we demonstrate the epigenetic influence of the hESC microenvironment on the reprogramming of aggressive melanoma cells using an innovative 3-D model. Specifically, our laboratory has previously demonstrated the redifferentiation of these melanoma cells to a more melanocyte-like phenotype (Postovit et al., Stem Cells 24(3):501-505, 2006), and now we show the loss of VE-Cadherin expression (indicative of a plastic vasculogenic phenotype) and the loss of Nodal expression (a plasticity stem cell marker) in tumor cells exposed to the hESC microenvironment. Further studies with the 3-D culture model revealed the epigenetic influence of aggressive melanoma cells on hESCs resulting in the down-regulation of plasticity markers and the emergence of phenotype-specific genes. Additional studies with the aggressive melanoma conditioned matrix microenvironment demonstrated the transdifferentiation of normal melanocytes into melanoma-like cells exhibiting a vasculogenic phenotype. Collectively, these studies have advanced our understanding of the epigenetic influence associated with the microenvironments of hESCs and aggressive melanoma cells, and shed new light on their therapeutic implications. Moreover, we have a better appreciation of the convergence of embryonic and tumorigenic signaling pathways that might stimulate further consideration of targeting Nodal in aggressive tumor cells resulting in a down-regulation of tumorigenic potential and plasticity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,483
Score d'incertitude au seuil0,652

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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