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Enregistrement W1967142113 · doi:10.1002/jnr.10407

Lipid binding activity of a neuron‐specific protein NAP‐22 studied in vivo and in vitro

2002· article· en· W1967142113 sur OpenAlexaff
Akira Terashita, Nobuo Funatsu, Masato Umeda, Yukiko Shimada, Yoshiko Ohno‐Iwashita, Richard M. Epand, Shohei Maékawa

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience Research · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCaveolin-1 and cellular processes
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNapLipid raftMyristoylationPhosphatidylethanolamineBiochemistryCell biologySphingolipidRaftBiologyChemistryPhosphatidylcholineCholesterolPhosphorylationMembranePhospholipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There exists a microdomain called "raft" in the cell membrane. The enrichment of cholesterol and sphingolipids in its outer leaflet is well recognized. In contrast, little is known of the lipid composition of the inner leaflet of raft, where many acylated signal-transducing molecules, such as trimeric G proteins and protein tyrosine kinases, associate. NAP-22 is a neuronal protein localized on the inner leaflet of raft domain. This protein was found to bind cholesterol in the liposome. In this study, we further analyze the lipid binding activity of NAP-22 using eukaryotic and bacterial expression systems. In addition to cholesterol, NAP-22 showed a phosphatidylethanolamine (PE)- and polyphosphoinositide-dependent membrane binding in the liposome assay. The N-terminal myristoylation was essential for the liposome binding. The C-terminal deletion up to D61 showed little effect on the binding. The lipid binding region was hence judged to be in the N-terminal 60-amino-acid sequence. NAP-22 was then expressed in COS7 cells, and the intracellular localization was studied. Biochemical analysis showed the localization of NAP-22 in a Triton-insoluble low-density fraction. Cell staining analysis showed colocalization patterns of NAP-22 with PE and cholesterol in the membrane.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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