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Enregistrement W1967211333 · doi:10.1074/jbc.275.6.4345

The Peroxisome Proliferator Response Element of the Gene Encoding the Peroxisomal β-Oxidation Enzyme Enoyl-CoA Hydratase/3-Hydroxyacyl-CoA Dehydrogenase Is a Target for Constitutive Androstane Receptor β/9-cis-Retinoic Acid Receptor-mediated Transactivation

2000· article· en· W1967211333 sur OpenAlexaff
Altaf Kassam, Christopher J. Winrow, F Fernandez-Rachubinski, John P. Capone, Richard A. Rachubinski

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeroxisomeDehydrogenaseNuclear receptorEnzymeRetinoic acidChemistryRetinoic acid receptorPeroxisome proliferator-activated receptorBiochemistryGeneTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genes encoding the first two enzymes of the peroxisomal beta-oxidation pathway, acyl-CoA oxidase (AOx) and enoyl-CoA hydratase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (HD), contain upstream cis-acting regulatory regions termed peroxisome proliferator response elements (PPRE). Transcription of these genes is mediated through the binding of peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha), which binds to a PPRE as a heterodimer with the 9-cis-retinoic acid receptor (RXRalpha). Here we demonstrate that the HD-PPRE is also a target for the constitutive androstane receptor beta (CARbeta). In vitro binding analysis showed that CARbeta bound the HD-PPRE, but not the AOx-PPRE, as a heterodimer with RXRalpha. Binding of CARbeta/RXRalpha to the HD-PPRE occurred via determinants that overlap partially with those required for PPARalpha/RXRalpha binding. In vivo, CARbeta/RXRalpha activated transcription from an HD-PPRE luciferase reporter construct. Interestingly, CARbeta was shown to also modulate PPARalpha/RXRalpha-mediated transactivation in a response element-specific manner. In the presence of the peroxisome proliferator, Wy-14,643, CARbeta had no effect on PPARalpha/RXRalpha-mediated transactivation from the HD-PPRE but antagonized transactivation from the AOx-PPRE in both the presence and the absence of proliferator. Our results illustrate that transcription of the AOx and HD genes is differentially regulated by CARbeta and that the HD gene is a specific target for regulation by CARbeta. Overall, this study proposes a novel role for CARbeta in the regulation of peroxisomal beta-oxidation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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