The Somatostatin-28(1−12)-NPAMAP Sequence: An Essential Helical-Promoting Motif Governing Prosomatostatin Processing at Mono- and Dibasic Sites
Notice bibliographique
Résumé
Proline residues, known to have special structural properties, induce particular conformations which participate in some biological functions. Two prolines (Pro(-9), Pro(-5)) located near the processing sites (Arg(-15) and Arg(-2)Lys(-)(1)) of human prosomatostatin were previously shown to be important for cleavage of the precursor into somatostatin-28 (S-28) and somatostatin-14 (S-14) [Gomez et al. (1989) EMBO J. 8, 2911-2916]. In this study, the importance of the pentapeptide P-A-M-A-P sequence (P-(X)(3)-P pattern), located in the S-28(1-12) segment connecting the mono- and dibasic cleavage sites, was investigated by using site-directed mutagenesis. Analysis of prosomatostatin-derived peptides produced by expression of mutated cDNA species in Neuro2A cells indicated that (i) deletion of PAMAP decreased S-14 production, (ii) deletion of the two Pro residues almost abolished the cleavage at the dibasic site, and (iii) Pro displacement generating the AMAPP motif resulted in a decrease of S-28 production. Moreover, both theoretical and spectroscopic studies of synthetic peptides reproducing the S-28(1-12) sequence bearing critical mutations showed that this sequence can organize as an alpha helical structure. These observations demonstrate that NPAMAP constitutes an accurate alpha-helix nucleation motif allowing for the generation of equal amounts of S-28 and S-14 from their common precursor in Neuro2A cells. Moreover, they emphasize the importance of the S-28(1-12) segment joining Arg(-15) and Arg(-2)Lys(-1) cleavage sites whose conformational organization is essential for controlling their accessibility to the appropriate processing proteases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».