LEAKY PREZYGOTIC ISOLATION AND POROUS GENOMES: RAPID INTROGRESSION OF MATERNALLY INHERITED DNA
Notice bibliographique
Résumé
Accurate phylogenies are crucial for understanding evolutionary processes, especially species diversification. It is commonly assumed that "good" species are sufficiently isolated genetically that gene genealogies represent accurate phylogenies. However, it is increasingly clear that good species may continue to exchange genetic material through hybridization (introgression). Many studies of closely related species reveal introgression of some genes without others, often with more rapid introgression of maternally inherited chloroplast or mitochondrial DNA (cpDNA, mtDNA). We seek a general explanation for this biased introgression using simple models of common reproductive isolating barriers (RIBs). We compare empirically informed models of prezygotic isolation (for pre- and postinsemination mechanisms of both female choice and male competition) with postzygotic isolation and demonstrate that rate of introgression depends critically upon type of RIB and mode of genetic inheritance (maternal versus biparental versus paternal). Our frequency-dependent prezygotic RIBs allow much more rapid introgression of biparentally and maternally inherited genes than do commonly modeled postzygotic RIBs (especially maternally inherited DNA). After considering the specific predictions in the context of empirical observations, we conclude that our model of prezygotie RIBs is a general explanation for biased introgression of maternally inherited genomic components. These findings suggest that we should use extreme caution when interpreting single gene genealogies as species phylogenies, especially for cpDNA and mtDNA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».