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Enregistrement W1967460900 · doi:10.1158/1055-9965.epi-06-0257

Endometrial Cancer Risk Is Associated with Variants of the Mismatch Repair Genes <i>MLH1</i> and <i>MSH2</i>

2006· article· en· W1967460900 sur OpenAlexaffabout
Mario Beiner, Barry P. Rosen, Anthony Fyles, Ian Harley, Tuya Pal, Kathy Siminovitch, Shiyu Zhang, Ping Sun, Steven A. Narod

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalCoalition for Research in Women's HealthUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndometrial cancerMLH1MSH2Colorectal cancerOdds ratioAlleleInternal medicineMedicineOncologyCancerSingle-nucleotide polymorphismDNA mismatch repairGastroenterologyGeneticsBiologyGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Women with germ-line mutations in the mismatch repair genes (responsible for hereditary nonpolyposis colorectal cancer) face an increased risk of colonic and endometrial cancer. However, these germ-line mutations are rare and are responsible for fewer than 1% of endometrial cancers. Therefore, we examined whether or not common variants of the hereditary nonpolyposis colorectal cancer-associated genes might also be associated with an increased risk of endometrial cancer. Three single-nucleotide polymorphisms were selected in the MLH1 and MSH2 mismatch repair genes. All the various 672 women with endometrial cancer and 880 controls were genotyped. Each of these three single-nucleotide polymorphisms was associated with an increased risk of endometrial cancer. Carriers of the MLH1 nt-93 A allele were at a 1.5-fold increased risk of developing endometrial cancer compared with controls [95% confidence interval (95% CI), 1.2-2.0; P = 0.001]. The risk was higher for homozygote carriers [odds ratio (OR), 1.9; 95% CI, 1.2-3.2; P = 0.009]. For carriers of the MSH2 rs2303428 C allele, the OR was 1.4 (95% CI, 1.0-1.9; P = 0.05), and for carriers of the MSH2 rs2059520 G allele, the OR was 1.3 (95% CI, 1.0-1.7; P = 0.03). More than 9% of endometrial cancer cases carried a variant allele in both MLH1 and MSH2. For these women, the risk of endometrial cancer was particularly high (OR, 2.1; 95% CI, 1.2-3.6; P = 0.005). For patients younger than 50 years at diagnosis who carried both variants, the risk was even higher (OR, 3.4; 95% CI, 1.7-6.6; P = 0.0005). In summary, two common variant alleles of the MLH1 and MSH2 genes make a substantial contribution to endometrial cancer incidence in Ontario.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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