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Enregistrement W1967658153 · doi:10.1158/1538-7445.am2013-5436

Abstract 5436: Oct4 interaction with Hmgb2 regulates Akt signaling and the pluripotent gene expression signature.

2013· article· en· W1967658153 sur OpenAlexaff
P A Campbell, David J. Stewart, Michael A. Rudnicki

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtein kinase BBiologyHomeobox protein NANOGSOX2Cell biologyChromatinInduced pluripotent stem cellCancer researchSignal transductionGeneticsEmbryonic stem cellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Akt signaling impacts multiple cellular functions associated with the hallmark characteristics of pluripotency such as cell cycle progression, cell growth, and enhanced cellular survival. Constitutive Akt activation promotes the pluripotent state and has also been implicated in several forms of cancer. Recent studies have suggested that while Akt activation may be a positive factor, the active nuclear form of Akt is associated with poor prognosis for many cancers, including lung cancer. Here, we describe a novel transcriptional regulatory feedback loop between Oct4, Hmgb2, and Akt. We show that Akt signaling promotes Oct4 phosphorylation and stability. This maintains interaction with Akt, Hmbg2 and other members of the SET complex such as Nme1 and Set. Upon differentiation, when Akt is inactive, their decreased interaction is observed. A functional genomics approach was therefore employed to determine the relevance of Oct4 interaction with Hmgb2 in maintaining the pluripotent state. Despite its previously described role in Polycomb group recruitment and transcriptional repression in Drosophila, we find that Hmgb2 knockdown results in decreased Akt signaling and decreased expression of many Oct4 transcriptional targets including genes implicated in cell cycle regulation, DNA repair, chromatin structure, as well as the pluripotency regulators Oct4, Sox2, and Nanog. Taken together, our results suggest that Oct4, Hmgb2, and the SET complex participate in a PTM-dependent feed forward regulatory loop that promotes active Akt signaling and the pluripotent gene expression signature. Future work will be focused upon dissecting the role of this network in maintaining constitutive nuclear Akt activation and promoting the primitive epigenetic state found in cancer. These findings may provide insight into the role of Akt in lung cancer chemoresistance and suggest alternate targets for more efficacious treatment. Citation Format: Pearl A. Campbell, David J. Stewart, Michael A. Rudnicki. Oct4 interaction with Hmgb2 regulates Akt signaling and the pluripotent gene expression signature. [abstract]. In: Proceedings of the 104th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2013 Apr 6-10; Washington, DC. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2013;73(8 Suppl):Abstract nr 5436. doi:10.1158/1538-7445.AM2013-5436

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
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