MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1967698411 · doi:10.1074/jbc.275.2.847

Transcription of the Human c-Src Promoter Is Dependent on Sp1, a Novel Pyrimidine Binding Factor SPy, and Can Be Inhibited by Triplex-forming Oligonucleotides

2000· article· en· W1967698411 sur OpenAlexaff
Shawn Ritchie, Mark Boyd, Jason W.H. Wong, Keith Bonham

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensSaskatchewan Cancer AgencyUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransactivationProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcTranscription factorMolecular biologyOligonucleotideBiologyBinding siteChemistryCell biologyDNAPhosphorylationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The tyrosine kinase pp60(c-src) has been implicated in the regulation of numerous normal physiological processes as well the development of several human cancers. However, the mechanisms regulating its expression have not been addressed. In the present study, we report the presence of two Sp1/Sp3 binding sites and three polypurine:polypyrimidine (Pu:Py) tracts in the c-Src promoter that are essential for controlling expression. We demonstrate that Sp1, but not Sp3, is capable of activating the c-Src promoter and that Sp3 is also capable of inhibiting Sp1-mediated transactivation. The presence of multiple Pu:Py tracts conferred S1 sensitivity on plasmids in vitro, suggesting they are capable of adopting non B-DNA conformations. These tracts specifically bind a nuclear factor we named SPy (Src pyrimidine binding factor), which demonstrates both novel double- and single-stranded binding specificities. Mutations eliminating SPy binding compromised Src transcriptional activity, especially in concert with additional mutations affecting Sp1 binding, suggesting the two factors may cooperate in regulating c-Src expression. Finally, we demonstrate that triplex-forming oligonucleotides designed to target both Sp1 and SPy binding sites can down-regulate c-Src expression in vitro, suggesting a potential therapeutic approach to controlling c-Src expression in diseases where aberrant expression or activity has been documented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetMonoclonal and Polyclonal Antibodies ResearchTravaux en français237 207