Uncovering novel inter‐ and intrachromosomal chromosome 1 aberrations in follicular lymphomas by using an innovative multicolor banding technique
Notice bibliographique
Résumé
Follicular lymphoma (FL) is characterized by t(14;18)(q32;q21), which is the initial genetic perturbation in this disease. Additional genetic mutations are required to generate a fully malignant phenotype. Secondary chromosomal alterations seen in FL include prominent involvement of chromosome 1 in the form of balanced or unbalanced translocations, insertions, deletions, and duplications involving both the p and q arms. We investigated a diagnostically well defined set of 55 t(14;18)-positive FL cases with complex karyotypes by means of multicolor karyotyping. Sixteen cases showed involvement of chromosome 1 and were analyzed in further detail by a novel multicolor banding technique for this chromosome. We defined three groups showing varying complexity of chromosome 1 alterations. The first group revealed simple translocations, such as t(1;2), t(1;6), t(1;8), and t(1;17), involving breakpoints on either the p or the q arm of chromosome 1. The second group showed more complex rearrangements with translocations, insertions, regional duplications, and involvement of more than one partner chromosome with either the p or the q arm of chromosome 1. The third group was defined by highly complex rearrangements involving translocations, regional duplications, amplifications, and intrachromosomal band relocations affecting the entire chromosome 1. All three groups shared interchromosomal rearrangements of chromosome 1 with chromosome 8, often involving the MYC protooncogene site, amplification involving region 1q21-q31, and deletion involving region 1p36. Thus, the use of sophisticated multicolor molecular cytogenetic assays in the investigation of malignant lymphoma allows precise characterization of chromosomal alterations and will provide a better understanding of their biology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».