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Enregistrement W1967958271 · doi:10.1158/1538-7445.am2012-4983

Abstract 4983: Correlation telomere shortening in chronic lymphocytic leukemia cells with oxidative stress and dysregulation of shelterin proteins

2012· article· en· W1967958271 sur OpenAlexaff
Ganchimeg Ishdorj, Sabine Mai, Yunli Zang, Spencer B. Gibson, James B. Johnston

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensResearch Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésShelterinTelomereChronic lymphocytic leukemiaMolecular biologyOxidative stressBiologyDNA damageTelomere-binding proteinDNALeukemiaCancer researchImmunologyGeneticsEndocrinologyGeneDNA-binding protein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Telomeres are important in maintaining the integrity of the chromosomes. A series of shelterin proteins (TRF1, TRF2, RAP1, POT1a and b, TIPP1 and TIN2), are involved in the maintenance and synthesis of telomeres. In chronic lymphocytic leukemia (CLL), the telomeres are shorter than in normal B cells, with very short telomeres being associated with poor survival. The mechanism for this telomere shortening has been evaluated in the present study. We demonstrated in 150 CLL patients using a Q-RT-PCR assay that the median telomere length was similar in mutated IgVH (Mu-IgVH) cases as in normal B cells, but was significantly shorter in unmutated (Un-IgVH) cases. However, there was considerable variation and overlap in telomere length between the groups. In addition, telomere length was found to shorten in both IgVH mutated and unmutated groups when patients were sequentially followed over years indicating that telomere shortening was an ongoing process. When lymphocytes were stimulated and the telomeres evaluated in metaphase by Q-FISH, telomere length shortening affected all chromosomes equally. To determine if telomere shortening in CLL cells was related to increased free radical formation, we measured plasma lipid peroxidation level (Lipid Hydroperoxide (LPO) assay, Cayman) and DNA breaks (gamma H2AX). As compared to normal B cells, there was increased lipid peroxidation and DNA breaks in both mutated and unmutated CLL cells. When cells were treated with N-acetyl-L-cysteine to scavenge free radicals, there was a decrease in DNA breakage. To assess, whether these changes were associated with alterations of the shelterin complex, protein levels of the shelterins were measured. TRF1 and TRF2 protein levels were increased in all patients compared to normal B cells. TRF2 was also increased in the cytoplasm of CLL cells. Following drug induced apoptosis in CLL cells TRF2 levels decreased but not TRF1 levels. In summary, these studies suggest that the short telomeres in CLL may be related to increased oxidative stress in these cells. TRF1 and TRF2 levels were increased in CLL cells regardless of telomere length suggesting that abnormalities in these proteins may also be involved in telomere shortening. Ongoing studies are evaluating the mechanisms responsible for the shelterin changes in CLL cells and whether altering the levels of these proteins can influence cell death. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 4983. doi:1538-7445.AM2012-4983

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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