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Enregistrement W1968028474 · doi:10.1021/bi002170u

Peptide Models of the Helical Hydrophobic Transmembrane Segments of Membrane Proteins:  Interactions of Acetyl-K<sub>2</sub>-(LA)<sub>12</sub>-K<sub>2</sub>-Amide with Phosphatidylethanolamine Bilayer Membranes

2000· article· en· W1968028474 sur OpenAlexaff
Yuanpeng Zhang, Ruthven N.A.H. Lewis, Robert S. Hodges, Ronald N. McElhaney

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryPeptideDifferential scanning calorimetryEnthalpyCrystallographyBilayerCooperativityLipid bilayerMembraneEndothermAmideAnalytical Chemistry (journal)ChromatographyOrganic chemistryThermodynamicsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-sensitivity differential scanning calorimetry (DSC) and Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy were used to study the interaction of a synthetic alpha-helical hydrophobic transmembrane peptide, acetyl-Lys(2)-(Leu-Ala)(12)-Lys(2)-amide [(LA)(12)], and members of a homologous series of n-saturated diacylphosphatidylethanolamines (PEs). In the lower range of peptide mole fractions, the DSC endotherms exhibited by the lipid/peptide mixtures consist of two components. The temperature and cooperativity of the sharper, higher temperature component are very similar to those of pure PE bilayers and are almost unaffected by variations in the protein/lipid ratio. However, the fractional contribution of this component to the total enthalpy changes decreases with increases in peptide concentration, and this component completely disappears at higher protein mole fractions. The other component, which is less cooperative and occurs at a lower temperature, predominates at higher protein concentrations. These two components of the DSC endotherm have been assigned to the chain-melting phase transitions of peptide-nonassociated and peptide-associated PE molecules, respectively. Although the temperature at which the peptide-associated PE molecules melt is progressively decreased by increases in (LA)(12) concentration, the magnitude of this downward shift is progressively greater as the length of the PE hydrocarbon chain decreases. As well, mixtures of (LA)(12) with the longer chain PEs exhibit unusual biomodal enthalpy variations, suggesting peptide immiscibility in thicker gel state bilayers. Moreover, the enthalpy of the chain-melting transition of the peptide-associated PE does not decrease to zero even at high peptide concentrations, indicating that (LA)(12) attenuates but does not abolish the cooperative gel/liquid-crystalline phase transition of the lipids with which it is in contact. Our FTIR spectroscopic data indicate that (LA)(12) remains in a predominantly alpha-helical conformation in liquid-crystalline PE bilayers of various hydrophobic thickness but that the helical conformation is altered in gel-state PE bilayers generally, probably due to peptide lateral aggregation. These data also suggest that (LA)(12) significantly disorders the hydrocarbon chains of adjacent PE molecules in both the gel and liquid-crystalline states, relatively independently of lipid hydrocarbon chain length. Many aspects of PE/(LA)(12) interactions exhibit a different dependence on the hydrophobic thickness of the host bilayer than was observed in our previous study of (LA)(12)-phosphatidylcholine (PC) model membranes [Zhang et al. (1995) Biochemistry 34, 2362-2371]. The differing effects of (LA)(12) incorporation on PE and PC bilayers is ascribed primarily to the much stronger lipid polar headgroup interactions characteristic of the former system. Finally, the considerable differences observed in the behavior of (LA)(12) and the related polyleucine-based peptide P(24) in both PC and PE bilayers indicate that the structure of the hydrophobic core of alpha-helical transmembrane peptides can affect their conformational plasticity and state of aggregation and thus the nature of their interactions with different phospholipid bilayers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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