Extended Apolar β-Peptide Foldamers: The Role of Axis Chirality on β-Peptide Sheet Stability
Notice bibliographique
Résumé
This study is on structure and stability of sheetlike conformers of beta-peptides; never seen new foldamers are reported here for the first time. Single- and double-stranded structures are analyzed, and the seeds of large beta-layers and biocompatible nanomaterials are described here. Both the monomeric, HCO-[NH-CH(2)-CH(2)CO](n)-NH(2), and dimeric forms, [HCO-(beta-Ala)(n)-NH(2)](2) n = 3 and 4, of oligo-beta-alanine supramolecular complexes are evaluated by using an adequate level of theory M052X/6-31G(d) for peptides of this size. Polymers composed of backbone foldamers with the central mu torsion angle set to an anti orientation were all probed. Sheet structures built up of strands with carbonyl groups monotonically facing the same spatial direction, polar strands, were previously assigned and synthesized ( Seebach , D. Chem. Biodiversity 2004 , 1 , 1111 - 1239 ). Now we are presenting a novel beta-peptide sheet structure of alternating carbonyl group orientations, called as apolar strands. These novel secondary structural elements of beta-peptides are structural analogs of beta-pleated sheets of proteins. Interestingly enough, the latter type of apolar strands are foreseen as very stable supramolecular complexes and are more firm by approximately 10 kcal.mol(-1) than the aforementioned polar strands. Furthermore, apolar strands lack the inherent twisting of beta-layers, present in polar strands resulting in the tubular shape. Once the effect of substitution of Hbeta1 and/or Hbeta2 atoms are revealed on foldamer stability, short peptide sequence could be designed and synthesized. These new, conformationally optimized beta-sheetlike nanostructures of increased stability with little or no twisting could be used as enzymatically resistant ( Frackenpohl , J. , Arvidsson , P. I. , Schreiber , J. V. , and Seebach , D. ChemBioChem 2001 , 2 , 445 - 455 ) biomaterials. These newly designed models systems could enlarge the arsenal of durable polyesters of similar chemical constitution (e.g., -[O-CH(CH(3))-CH(2)CO](n)- and -[O-CH(COOH)-CH(2)CO](n)-) already used as artificial heart valves, for example.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».