Mutations in the DNA-binding codons of TP53, which are associated with decreased expression of TRAILreceptor-2, predict for poor survival in diffuse large B-cell lymphoma
Notice bibliographique
Résumé
Mutations of the TP53 tumor suppressor gene have been associated with poor survival in some series of diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) but not in other studies. The purpose of this study was to identify the frequency of TP53 alterations (mutations or deletions), characterize the gene expression of mutant/deleted cases, and determine the effects of mutations on survival. In a series of DLBCL that had previous gene expression profiling, we identified 24 mutations in 113 cases (21%). There was no difference in the frequency of mutations in the molecular subgroups of DLBCL. Twelve (50%) of the 24 cases had mutations localized to the DNA-binding codons in the core domain of TP53. The presence of any TP53 mutation correlated with poor overall survival (OS; P = .044), but DNA-binding mutations were the most significant predictor of poor OS (P < .001). Multivariate analysis confirmed that the International Prognostic Index, tumor size, and TP53 DNA-binding mutations were independent predictors of OS. Gene expression analysis showed that TRAILreceptor-2 (DR5) was the most differentially underexpressed gene in the TP53 mutated cases. Investigation is warranted into targeted therapy toward TRAIL receptor-2, to potentially bypass the adverse effect of mutated TP53 in DLBCL.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».