Molecular analysis of the human thrombin‐activatable fibrinolysis inhibitor gene promoter
Notice bibliographique
Résumé
Thrombin-activatable fibrinolysis inhibitor (TAFI) is a carboxypeptidase B-like pro-enzyme that, once activated, attenuates fibrinolysis. Little is presently known of the factors that regulate expression of CPB2, the gene encoding TAFI. This study identified 10 potential transcription factor binding sites (denoted A-J) within the proximal promoter region of CPB2, spanning nucleotides -425 to +21; two of these represent previously-described binding sites for CCAAT/enhancer binding protein and glucocorticoid receptor. We identified additional transcription factors that bind within the proximal CPB2 promoter, namely, nuclear factor-Y (NF-Y) and hepatocyte nuclear factor-1alpha (HNF-1alpha). Binding of NF-Y to the region between nucleotides -76 to -59 (Site B) is important for basal CPB2 promoter activity; NF-Y may be a key factor for the recruitment of the transcriptional machinery to the TAFI gene promoter. HNF-1alpha binds at the interface between Sites C and B. Transient transfections of CPB2 promoter-reporter constructs showed that HNF-1alpha binding is essential for the activity of this promoter in HepG2 cells, indicating that HNF-1alpha is involved in the liver-specific expression of CPB2.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».