Kaiso Represses the Cell Cycle Gene cyclin D1 via Sequence-Specific and Methyl-CpG-Dependent Mechanisms
Notice bibliographique
Résumé
Kaiso is the first member of the POZ family of zinc finger transcription factors reported to bind DNA with dual-specificity in both a sequence- and methyl-CpG-specific manner. Here, we report that Kaiso associates with and regulates the cyclin D1 promoter via the consensus Kaiso binding site (KBS), and also via methylated CpG-dinucleotides. The methyl-CpG sites appear critical for Kaiso binding to the cyclin D1 promoter, while a core KBS in close proximity to the methyl-CpGs appears to stabilize Kaiso DNA binding. Kaiso's binding to both sites was demonstrated in vitro using electrophoretic mobility shift assays (EMSA) and in vivo using Chromatin immunoprecipitation (ChIP). To elucidate the functional relevance of Kaiso's binding to the cyclin D1 promoter, we assessed Kaiso overexpression effects on a minimal cyclin D1 promoter-reporter that contains both KBS and CpG sites. Kaiso repressed this minimal cyclin D1 promoter-reporter in a dose-dependent manner and transcriptional repression occurred in a KBS-specific and methyl-CpG-dependent manner. Collectively our data validates cyclin D1 as a Kaiso target gene and demonstrates a mechanism for Kaiso binding and regulation of the cyclin D1 promoter. Our data also provides a mechanistic basis for how Kaiso may regulate other target genes whose promoters possess both KBS and methyl-CpG sites.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».