Phylogeography and predicted distribution of African-Arabian and Malagasy populations of giant mastiff bats, Otomops spp. (Chiroptera: Molossidae)
Notice bibliographique
Résumé
Otomops martiensseni is sparsely distributed throughout sub-Saharan Africa and southwestern Arabia (Yemen). Otomops madagascariensis from the dry portions of Madagascar is widely recognised to be a distinct species. Based on mitochondrial DNA sequences of the cytochrome b gene (1,004 base pairs; n = 50) and the control region (D-loop, 290 base pairs; n = 52), two Oriental outgroup species (O. wroughtoni and O. cf. formosus) formed a monophyletic clade that was the sister group to the Afro-Malagasy taxa, composed of O. martiensseni and O. madagascariensis. Within the Afro-Malagasy clade, we discovered three well-supported but genetically similar clades (inter-clade genetic distances of 3.4–4.4%) from 1) north-eastern Africa and Arabia, 2) African mainland except northeast Africa, and 3) Madagascar. Taken together, haplotype networks, estimated divergence times, regional species richness and historical demographic data tentatively suggested dispersal from Asia to Africa and Madagascar. To understand ecological determinants of phylogeographic, biogeographic and genetic structure, we assessed the potential distribution of O. martiensseni throughout sub-Saharan Africa with ecological niche modelling (MaxEnt) based on known point localities (n = 60). The species is predicted to occur mainly in woodlands and forests and in areas of rough topography. Continuity of suitable habitats supported our inferred high levels of continental gene flow (relatively low genetic distances), and suggested that factors other than habitat suitability have resulted in the observed phylogeographic structure (e.g., seasonal mass migrations of insects that might be tracked by these bats). Based on a Bayesian relaxed clock approach and two fossil calibration dates, we estimated that African and Oriental clades diverged at 4.2 Mya, Malagasy and African clades at 1.5 Mya, and African clades 1 and 2 at 1.2 Mya. Integrating phylogenetic, phylogeographic, population genetic and ecological approaches holds promise for a better understanding of biodiversity patterns and evolutionary processes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».