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Enregistrement W1968255815 · doi:10.1021/bi001643u

Hsp70s Contain a Specific Sulfogalactolipid Binding Site. Differential Aglycone Influence on Sulfogalactosyl Ceramide Binding by Recombinant Prokaryotic and Eukaryotic Hsp70 Family Members

2001· article· en· W1968255815 sur OpenAlexaff
Daniel Mamelak, Murugesapillai Mylvaganam, Heather Whetstone, E. Hartmann, William J. Lennarz, Priscilla B. Wyrick, Jane E. Raulston, Hongmei Han, Paul S. Hoffman, Clifford A. Lingwood

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésBiologyAglyconeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Specific 3'-sulfogalactolipid [SGL-sulfogalactosyl ceramide (SGCer) and sulfogalactosylglycerolipid (SGG)] binding is compared for hsp70s cloned from Helicobacter pylori, Haemophilus influenzae, Chlamydia trachomatis serovar E, Escherichia coli, murine male germ cells, and the hsp70-like extracellular domain within the sperm receptor from Strongylocentrotus purpuratus. This lectin activity, conserved among the different hsp70 family members, is modulated by the SGL aglycone. This is shown by differential binding to both SGC fatty acid homologues and 3'-sulfogalactolipid neoglycoproteins generated by coupling bovine serum albumin (BSA) and glycosyl ceramide acids synthesized by oxidation of the double bond of sphingosine. Eukaryotic hsp70s preferentially bound the SGCer fatty acid homologues SG(24)Cer, SG(18)Cer, and SG(20:OH)Cer, while prokaryotic hsp70s bound SG(18:1)Cer and SG(20:OH)Cer. Eukaryotic hsp70s bound SGCer-BSA and SG(24)Cer-BSA conjugates where the latter is the main constituent in SGCer-BSA, while prokaryotic hsp70s bound SG(20:OH)Cer-BSA. None of the hsp70s bound sulfogalactosyl sphingosine (SGSph) or SGSph-BSA, further demonstrating the important role of the aglycone. Although the primary SGL recognition domain of all hsp70s is conserved, we propose that aglycone organization differentially influences the interaction with the sub-site. Heterogeneous SGCer aglycone isoforms in cells and the differential in vitro binding of eukaryotic and prokaryotic hsp70s may relate to their different adhesin roles in vivo as mediators of germ cell and bacterial/host interactions, respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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