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Enregistrement W1968345118 · doi:10.1093/nar/gkm1099

Dlx2 homeobox gene transcriptional regulation of Trkb neurotrophin receptor expression during mouse retinal development

2007· article· en· W1968345118 sur OpenAlexaff
Jimmy de Melo, Qing-Ping Zhou, Qi Zhang, Shunzhen Zhang, Mario Fonseca, Jeffrey T. Wigle, David D. Eisenstat

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensSt. Boniface HospitalChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTropomyosin receptor kinase BHomeoboxCell biologyEctopic expressionGeneticsTranscription factorNeurotrophic factorsReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dlx homeobox genes are first expressed in embryonic retina at E11.5. The Dlx1/Dlx2 null retina has a reduced ganglion cell layer (GCL), with loss of late-born differentiated retinal ganglion cells (RGCs) due to increased apoptosis. TrkB signaling is proposed to regulate the dynamics of RGC apoptosis throughout development. DLX2 expression markedly precedes the onset of TrkB expression in the GCL; TrkB co-expression with Dlx2 and RGC markers is well-established by E13.5. In the Dlx1/Dlx2 null retina, TrkB expression is significantly reduced by E16.5. We demonstrated that DLX2 binds to a specific region of the TrkB promoter in retinal neuroepithelium during embryogenesis. In vitro confirmation and the functional consequences of DLX2 binding to this TrkB regulatory region support TrkB as a Dlx2 transcriptional target. Furthermore, ectopic Dlx2 expression in retinal explants activates TrkB expression and Dlx2 knockdown in primary retinal cultures results in reduced TrkB expression. RGC differentiation and survival require the coordinated expression of transcription factors. This study establishes a direct transcriptional relationship between a homeodomain protein involved in RGC differentiation and a neurotrophin receptor implicated in RGC survival. Signaling mediated by TrkB may contribute to survival of late-born RGCs whose terminal differentiation is regulated by Dlx gene function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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