<i>Gpnmb</i> is a melanoblast‐expressed, MITF‐dependent gene
Notice bibliographique
Résumé
Expression profile analysis clusters Gpnmb with known pigment genes, Tyrp1, Dct, and Si. During development, Gpnmb is expressed in a pattern similar to Mitf, Dct and Si with expression vastly reduced in Mitf mutant animals. Unlike Dct and Si, Gpnmb remains expressed in a discrete population of caudal melanoblasts in Sox10-deficient embryos. To understand the transcriptional regulation of Gpnmb we performed a whole genome annotation of 2,460,048 consensus MITF binding sites, and cross-referenced this with evolutionarily conserved genomic sequences at the GPNMB locus. One conserved element, GPNMB-MCS3, contained two MITF consensus sites, significantly increased luciferase activity in melanocytes and was sufficient to drive expression in melanoblasts in vivo. Deletion of the 5'-most MITF consensus site dramatically reduced enhancer activity indicating a significant role for this site in Gpnmb transcriptional regulation. Future analysis of the Gpnmb locus will provide insight into the transcriptional regulation of melanocytes, and Gpnmb expression can be used as a marker for analyzing melanocyte development and disease progression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».