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Enregistrement W1968348960 · doi:10.1016/j.jalz.2013.12.019

Harmonized benchmark labels of the hippocampus on magnetic resonance: The EADC‐ADNI project

2014· article· en· W1968348960 sur OpenAlexafffund
Martina Bocchetta, Marina Boccardi, Rossana Ganzola, Liana G. Apostolova, Gregory M. Preboske, Dominik Wolf‎, Clarissa Ferrari, Patrizio Pasqualetti, Nicolas Robitaille, Simon Duchesne, Clifford R. Jack, Giovanni B. Frisoni, George Bartzokis, Charles DeCarli, Leyla deToledo‐Morrell, Andreas Fellgiebel, Michael Firbank, Lotte Gerritsen, Wouter J.P. Henneman, Ronald Killiany, Nikolai Malykhin, Jens C. Pruessner, Hilkka Soininen, Lei Wang, Craig Watson, Henrike Wolf

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueMemory and Neural Mechanisms
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut Universitaire en Santé Mentale de Québec
Organismes subventionnairesJanssen Research and DevelopmentNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, San FranciscoJohns Hopkins UniversityUniversity of California, San DiegoPfizerUniversity of California, Los AngelesAlzheimer's Drug Discovery FoundationNational Institutes of HealthInnogeneticsUniversity of California, DavisFoundation for the National Institutes of HealthUniversity of Southern CaliforniaEisaiGentofte HospitalBayer HealthCareGE HealthcareKing's College LondonNorthern California Institute for Research and EducationAmorfix Life SciencesF. Hoffmann-La RocheRush UniversityIXICOTakeda Pharmaceutical CompanyNovartis Pharmaceuticals CorporationDeutsches Zentrum für Neurodegenerative ErkrankungenBristol-Myers SquibbUniversité LavalBiogenBioClinicaAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsRocheUniversiteit MaastrichtMedpaceAstraZenecaGenentechBiogen IdecSynarcUniversity of AlbertaSchool of Medicine, Boston UniversityServierKuopion Yliopistollinen SairaalaWyethAbbott FundEli Lilly and CompanyMcGill UniversityAlzheimer's AssociationKarolinska InstitutetMerck
Mots-clésHARPMagnetic resonance imagingIntraclass correlationSegmentationBenchmark (surveying)NeuroimagingSimilarity (geometry)Artificial intelligenceComputer scienceConfidence intervalPattern recognition (psychology)MedicinePsychologyNeuroscienceRadiologyCartographyInternal medicineDevelopmental psychologyPhysicsPsychometrics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A globally harmonized protocol (HarP) for manual hippocampal segmentation based on magnetic resonance has been recently developed by a task force from European Alzheimer's Disease Consortium (EADC) and Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI). Our aim was to produce benchmark labels based on the HarP for manual segmentation. METHODS: Five experts of manual hippocampal segmentation underwent specific training on the HarP and segmented 40 right and left hippocampi from 10 ADNI subjects on both 1.5 T and 3 T scans. An independent expert visually checked segmentations for compliance with the HarP. Descriptive measures of agreement between tracers were intraclass correlation coefficients (ICCs) of crude volumes and similarity coefficients of three-dimensional volumes. RESULTS: Two hundred labels have been provided for the 20 magnetic resonance images. Intra- and interrater ICCs were >0.94, and mean similarity coefficients were 1.5 T, 0.73 (95% confidence interval [CI], 0.71-0.75); 3 T, 0.75 (95% CI, 0.74-0.76). CONCLUSION: Certified benchmark labels have been produced based on the HarP to be used for tracers' training and qualification.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,262
Score d'incertitude au seuil0,477

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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