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Enregistrement W1968349170 · doi:10.3389/fmicb.2015.00008

Efflux-mediated fluoroquinolone resistance in the multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa clinical isolate PA7: identification of a novel MexS variant involved in upregulation of the mexEF-oprN multidrug efflux operon

2015· article· en· W1968349170 sur OpenAlexfundno aff
Yuji Morita, Junko Tomida, Yoshiaki Kawamura

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceQueen's University
Mots-clésEffluxPseudomonas aeruginosaMultiple drug resistanceMicrobiologyOperonBiologyDrug resistanceMutantBacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The emergence of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa has become a serious problem in medical settings. P. aeruginosa clinical isolate PA7 is resistant to fluoroquinolones, aminoglycosides, and most β-lactams but not imipenem. In this study, enhanced efflux-mediated fluoroquinolone resistance of PA7 was shown to reflect increased expression of two resistance nodulation cell division (RND) -type multidrug efflux operons, mexEF-oprN and mexXY-oprA. Such a clinical isolate has rarely been reported because MexEF-OprN-overproducing mutants often increase susceptibility to aminoglycosides apparently owing to impairment of the MexXY system. A mutant of PA7 lacking three RND-type multidrug efflux operons (mexAB-oprM, mexEF-oprN, and mexXY-oprA) was susceptible to all anti-pseudomonas agents we tested, supporting an idea that these RND-type multidrug efflux transporters are molecular targets to overcome multidrug resistance in P. aeruginosa. mexEF-oprN-upregulation in P. aeruginosa PA7 was shown due to a MexS variant harboring the Valine-155 amino acid residue. This is the first genetic evidence shown that a MexS variant causes mexEF-oprN-upregulation in P. aeruginosa clinical isolates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,641
Score d'incertitude au seuil0,890

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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