MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1968431759 · doi:10.1504/ijbra.2013.056620

Challenges in the miRNA research

2013· review· en· W1968431759 sur OpenAlexaff
Tiratha Raj Singh, Arun Gupta, Prashanth Suravajhala

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Bioinformatics Research and Applications · 2013
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensBombardier (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésmicroRNABiologyComputational biologyGeneAnnotationGeneticsBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

While it is known that the human genes are regulated by microRNAs (miRNAs), recent links with cancer and other diseases have widely caught interest. With several bioinformatics platforms and approaches on rise that has led to discovery of human miRNAs, validation and need for understanding miRNAs from their progenitor messenger RNAs (mRNAs) have arisen. Furthermore, the miRNAs are known to have synergism involving regulation of their condition-specific target genes (mRNAs). In this review, we provide a bioinformatics approach of the miRNAs and their challenges with respect to annotation. With introduction of sequence-specific miRNA signatures recently found, we discussed myriad of dimensions where miRNAs are being associated with several putative functional and evolutionary events, and then we asked a question how far and relevant is the association of miRNAs with mRNAs?

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,992
Score d'incertitude au seuil0,355

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,285
Tête enseignante GPT0,496
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of Bioinformatics Research and ApplicationsMême sujetMicroRNA in disease regulationTravaux en français237 207