Multilocus structure in the<i>Pinus contorta – Pinus banksiana</i>complex
Notice bibliographique
Résumé
Natural hybridization between lodgepole pine ( Pinus contorta Dougl. ex Loud.) and jack pine ( Pinus banksiana Lamb.) in western Canada provides a distinct opportunity to infer evolutionary and demographic determinants of nonrandom associations of the alleles at different loci occurring in this Pinus contorta – Pinus banksiana complex (PCBC). Here, we investigated multilocus associations among and within 40 PCBC populations sampled from central and northwestern Alberta, using 39 random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. For each of the 40 PCBC populations, we examined distributions of 741 pairs of linkage (gametic) disequilibria (LD) between the 39 RAPDs and measured the “average” multilocus associations using the summary statistics that allow for packaging of individual LD in each population. We then partitioned the variance of LD in the total population to assess the causes of multilocus population structure. The results showed that (i) LD were more prominent in hybrid populations than in parental populations; (ii) multilocus Wahlund effect was a much more important determinant of population structure than its single-locus counterpart, particularly in hybrid populations; and (iii) considerable mutlilocus associations across the populations within each taxa group was due to the presence of different multilocus haplotypes in different populations. Such results are best explained by the fact that PCBC populations are geographically and ecologically marginal and are produced at the balance between mixing of two distinct gene pools creating new recombinants and selection in favor of parental gametes, but against the recombinants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».