High Throughput Sequencing Reveals Alterations in the Recombination Signatures with Diminishing Spo11 Activity
Notice bibliographique
Résumé
Spo11 is the topoisomerase-like enzyme responsible for the induction of the meiosis-specific double strand breaks (DSBs), which initiates the recombination events responsible for proper chromosome segregation. Nineteen PCR-induced alleles of SPO11 were identified and characterized genetically and cytologically. Recombination, spore viability and synaptonemal complex (SC) formation were decreased to varying extents in these mutants. Arrest by ndt80 restored these events in two severe hypomorphic mutants, suggesting that ndt80-arrested nuclei are capable of extended DSB activity. While crossing-over, spore viability and synaptonemal complex (SC) formation defects correlated, the extent of such defects was not predictive of the level of heteroallelic gene conversions (prototrophs) exhibited by each mutant. High throughput sequencing of tetrads from spo11 hypomorphs revealed that gene conversion tracts associated with COs are significantly longer and gene conversion tracts unassociated with COs are significantly shorter than in wild type. By modeling the extent of these tract changes, we could account for the discrepancy in genetic measurements of prototrophy and crossover association. These findings provide an explanation for the unexpectedly low prototroph levels exhibited by spo11 hypomorphs and have important implications for genetic studies that assume an unbiased recovery of prototrophs, such as measurements of CO homeostasis. Our genetic and physical data support previous observations of DSB-limited meioses, in which COs are disproportionally maintained over NCOs (CO homeostasis).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».