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Enregistrement W1968470874 · doi:10.1002/cbic.201200121

Revisiting the Specificity of an α‐(1→4)‐Mannosyltransferase Involved in Mycobacterial Methylmannose Polysaccharide Biosynthesis

2012· article· en· W1968470874 sur OpenAlexafffund
Li Xia, Ruixiang Blake Zheng, Todd L. Lowary

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensAlberta Glycomics CentreUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Glycomics Centre
Mots-clésResidue (chemistry)MannoseChemistryBiosynthesisGlycosyltransferaseBiochemistryEnzymeTransferaseStereochemistryGlycolipid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In order to evaluate the proposed biosynthetic pathway for the methylmannose (MMPs) polysaccharides produced by mycobacteria, two homologous series of synthetic α-(1→4)-linked 3-O-methyl-mannopyranosides, one terminated at the non-reducing end by a free mannopyranose residue (unmethylated oligosaccharides; OS) and the other terminated by a 3-O-methyl-mannopyranose residue (methylated OS), were prepared and evaluated as potential acceptors of an α-(1→4)-mannosyltransferase. Using a mycobacterial membrane preparation as the source of the transferase, it was found that unmethylated OS are better substrates for the enzyme compared to the methylated OS of the same length. These results are inconsistent with the proposed MMP biosynthetic pathway, which suggests only methylated OS are acceptors of this transferase. To confirm that the observed activity arose from the desired α-(1→4)-mannosyltransferase, as opposed to other mannosyltransferases present in the membrane preparation, the products resulting from tetrasaccharides 4 (unmethylated OS) and 9 (methylated OS), which only differ in the terminal residue, were further analyzed. MALDI-MS, exo-glycosidase digestion and (1) H NMR spectroscopy were used to evaluate the structures of these reaction products. These experiments revealed that the enzymatic products of both 4 and 9 contain only α-(1→4)-linked mannose residues, confirming the activity of the α-(1→4)-mannosyltransferase. This supports the finding that both methylated and unmethylated OS are acceptors of the enzyme. It was also demonstrated that a homologous series of oligosaccharides with different number of mannose residues were formed from both 4 and 9, as opposed to a single reaction product. These results, again, challenge the previously proposed MMP biosynthetic pathway involving alternating methylation and mannosylation reactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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